Ginkgo Bioworks는 당초 스탠퍼드 대학교 교수 Michael Jewett이 OpenAI의 AI 에이전트 팀과 단독으로 단백질 설계 경쟁을 벌이도록 할 계획이었다. 그러나 9월 14일 첫 대결을 앞두고 경기가 긴급 중단되었고, 이후 경기 방식은 '단독 대결'에서 '협력 경쟁(coopetition)'으로 변경되어 모든 과학자들이 팀을 구성하여 참여할 수 있게 되었다. Ginkgo의 공동 창립자이자 사장인 Reshma Shetty는 이러한 조치가 과학계의 인공지능에 대한 긴장감을 고조시키는 것을 피하기 위함이라고 밝혔다. 이러한 변화는 OpenAI가 9월 8일 AI 모델이 수학계를 거의 100년 동안 괴롭혔던 나비에-스토크스 문제를 해결했다고 발표한 이후 발생했으며, 이 소식은 전 세계 수학계에 큰 충격을 주었고 AI와 인류의 미래 관계에 대한 격렬한 논쟁을 다시 불러일으켰다. 재편된 경기는 10월 중순에 시작하여 연말까지 진행되며, 참가 팀은 Ginkgo가 지정한 세 가지 단백질에 대한 최적의 화학 배합 설계를 제출하고 로봇이 실험을 수행하여 평가하게 된다.